浮天远父子被抓住之后，三天之后即被判决处决。通过对他们的审讯，也揭发出一批曾经与他们同流合污的官员，人数达到二十余人。诸葛军师大怒，立刻命人将那些官员，无论还在职与否，全都逐一彻查。一旦发现证据，立刻将之免官，从重发落！
　　其中最让刘禅惊讶的一条招供是，刘琦居然也跟浮天远有勾结，甚至推荐东吴的人去跟浮天远合作，来绑架他！刘禅这才明白，石川施恩惠曾经提到的，他家的那张详细的路线图的来源了！可是刘禅实在不明白，刘琦一直以来跟刘备的关系不是都很好，待刘备如同亲叔叔一般吗？而且，刘备也已经表刘琦当荆州牧，领江夏太守之职吗？这样看来，刘备待他也算是不薄，没有像曹操那样狡兔死走狗烹，将刘琮给杀了。

　　由于刘琦的身份实在太敏感，刘琦和他的管家刘三都立刻被秘密逮捕起来。一个月后，在得到刘备的首肯之后，两人同时被秘密赐死，然后对外宣布刘琦病亡。其实，以刘琦良好的身体状况，是根本不可能那样早夭的。可是谁让他动不动就对外宣布，他要养病呢？这正好给了诸葛军师和刘备一个最好的杀他的借口。在刘琦被关押其间，刘禅并未去看望过他。因为他生气，他失落，他一直以为刘琦是个正直、文质彬彬的贵族，是个真心关怀他的亲人。可是其实不是，刘琦只是一个伪君子，他之所以来看自己，只是为了绘制自己家里的路线图！

　　刘琦死后，诸葛军师为他举行了隆重的丧礼，刘禅终于还是去参加了。他看到躺在双层棺椁里面的刘琦，身上穿着公族的盛装，脸色苍白而透着一丝青色，看起来依然是那样文质彬彬，可是他已经永远地离开这个世界了。刘禅心里暗叹，你这又是何必呢？日后，即使关羽那样的无敌战将，都无法完保荆州。你这样的软弱的人，又怎么做得到呢？刘禅向刘琦的遗体深深地鞠了一个躬后，带着赵风，失落地回到了江陵城。

　　但是刘禅其实也没有那么多的烦心事的。至少医国院的事情就让他感觉非常骄傲。它如期在半年后如期整修完毕，开始招生。这恐怕是世界史上第一家用来培养专业人才的学院（不要忘记，医国院并非专科医学院，里面还开设数科和账目科，刘禅其实已经想好了，今后还要开设更多的科系。）为了充分实现学院内部的自治，刘禅请华佗、祖文和自己一起担任学院的董事，监督学院的各项运行情况、院长的工作情况，以及学院内部的风纪。

　　华佗和张方平一直在担心的医国院的生源问题，在刘禅和诸葛先生两人的共通推动之下，很快得到良好的解决。刘禅很早以前就请诸葛先生发布命令，将荆州境内的所有医师进行登记，否则禁止其一切医疗活动。让刘禅惊讶的是，其实医师的数量，比自己猜想的要多得多，居然达到近1800人。他们从其中挑选出那些既有基础又年轻的人员，让他们分批进入医国院进行为期一年的培训，并由官府每月发给特殊补助，不过，每期只限定20人。

　　医科中有一个人比较特殊，不得不提一下。那就是赵风的妻子施惠。她从小就接受忍者训练，对毒药有深刻的认识。所以刘禅特别请董事会批准她，跟随张方平和华佗学习药物。因为刘禅有心要将她培养成毒药专家，将来可以为军队出力。
　　而账目科的生源就更加好办。荆州境内有大量文官在从事账目和粮草管理方面的工作。这些人都是从民间挑选而来的，虽然能够处理账目，但是没有进行过系统的训练，日后刘家的地盘大了的话，难免出现力不从心的情况。于是，这些人又被分作好几期，送入账目科培训。
　　由于刘禅事前和诸葛军师有约，不让官府干预医国院事务。现在诸葛军师这样大张旗鼓的帮忙，显然是违背刘禅自己的初衷的。刘禅就巧立名目，将这些培训美其名曰“官府医疗人员委托培训计划”。那么，官府当然就不可能再对学院指手画脚。这样的做法，立刻得到院长张方平和华佗的热烈支持。
　　至于数科，这是刘禅最为看重的科系之一。古代，中华民族虽然在数学领域一直处于世界领先水平。但是愿意研究数学的人，实在是少之又少，更没有形成完整系统的数学体系。这也是日后，中国科技大大落后西方的一个重要原因。但是在中国这样一个注重“实用”的国度，要找到愿意学习数学的学生实在太难。刘禅只好让祖文先将账目科弄好。数科先当作账目科的副科来教授。如果其中发现有什么优秀人才的话，可以尽一切可能将之挖过来。祖文原本就被数科的生源愁眉苦脸，听刘禅这么一说，立刻茅塞顿开，直呼大善。

　　日期：2011-06-24 09:10
　　一年之后，数科才找到两个很有天赋的学生，可真是让祖文高兴坏了。不过其中一个，还是张行先生以前的学生王羽。张行先生听说后，立刻对刘禅大发雷霆，说圣贤弟子，岂可去学那些旁门左道。刘禅只好装作没有听见，顾左右而言他，弄得张先生是毫无办法。
　　医科的第一批培训生的培训结束得比较顺利。这一年里面，他们每个人都学得非常认真。而且张方平在荆襄的名头很大，神医华佗的名头更是吓人，他们要是不抓住这个机会好好学习的话，那一定是傻子。经过考核后，20人之中居然只有7人毕业，通过率只有三分之一！真把刘禅吓了一跳，连忙跑去询问原因。原来，当初刘禅就跟两人说过，医师是关系人命的职业，所以一定要宽进严出。而张方平两人确实也只是照做而已。

　　刘禅想想倒也确实如此。看来是自己嘴巴无毛，办事不牢，把自己说过的话都忘记了，当即向两位先生道歉。然后三个董事经过研究后决定，让那三分之二的学生留下继续培训，组建特别班，允许他们每个月进行一次考核，只要通过就算毕业。这样才不会浪费太多的教育资源。
　　那毕业的7个学生的去向则比较特别。医国院一方面需要对荆州军的大力支持，表示一下自己的谢意，一方面需要替自己留下人才。所以就挑选出两个最优秀的外科人才，送到刘备所在的葭萌关担任医官。那里时有战事，正好让他们去积累经验，几年之内，应该就可成为成熟的外科医师。刘禅还亲自给刘备写了一封信，请他一定要保护好两人的人身安全，他们日后是要回到医国院来任教的。余下的五人，有三人被张飞的军队请去，两人送去赵云所在的公丨安丨。

　　那些留级的学员，见到每个毕业生都可以当上医官，心里顿时是既羡慕又后悔，自己当初为什么就不更加努力一点呢？他们的学习热情也就更加高涨了。
　　而经过祖文的账目科的培训之后，两批学选全都掌握阿拉伯数字极其运算法则。回去原职之后，办事效率一下子就提高数倍。对此，最高兴的人一定是诸葛军师。他是个追求完美的人，手下办事越有效率，他当然越高兴。
　　后来刘禅见祖文一个人教学，实在是太忙，有时候就自己亲自上阵。加减乘除的法则对古人而言，也许是挺难的，但是对前世是个重点本科大学生的刘禅而言，简直是小菜一碟。可是当他发觉自己一个小孩子，要在一群大人面前侃侃而谈的时候，感觉实在是非常怪异的。不过，他和学员们后来都慢慢地适应了这样尴尬的境况。而且，他有时候会突发奇想地讲解一些几何问题，好让学员日后处理土地纠纷，或者计量土地的时候使用。后来，刘禅讲课的名气也大了，每逢刘禅来凑趣讲课的时候，那两个数科的学生，都会偷偷混在账目科学员中来偷听。

　　当刘禅在医国院里面混得风生水起的时候，他的在外面的名声也变得越来越大。而且华佗有带学生四处义诊的习惯，更是为刘禅和医国院博得了好名声。这些都使得刘禅“神童”之名鹊起，一时间是风头无两，完全盖过魏王曹操已逝的爱子曹冲和东吴诸葛瑾一双爱子诸葛恪和诸葛乔的风头。大家都开始相信，刘禅真的就是天上的北斗星下凡，否则小小年纪，怎么可能做出这么多连大人都做不到的事情呢？